1699年

伍德沃德通过实验得出泥水比雨水或河水更能促进植物生长的论断。
爱德华·泰森撰写《中非洲矮黑人解剖体和人、猴、猿解剖体作比较》一书，这是探讨类人猿解剖的第一次尝试，并用猴解剖和人体结构比较，为比较形态学奠定了基础。

医学

1699年

3月，康熙第3次南巡。因黄、淮连年崩决，下游时遭水淹，虽耗银无数仍无成效，故康熙南巡查看河道，指示方略。后再巡历江浙，察吏安民。
4月，大赦山东江南两省在监罪犯。

经济

1699年

萨弗里以活动蒸汽机模型在英国皇家学会作了成功的演示。

1699年

托拉内奥发表了对淋病的各种类型和各个阶段的论述。

工程技术

1699年

5月14日，康熙命修明太祖陵并为明陵题“治隆唐宋”殿额。
钦定《春秋传说汇编》38卷。

政法

1699年

阿蒙东[法]发表有关摩擦的定律。

化学

1699年

8月，牛顿用改进型的六分仪与月相观测结合起来，实现在海上测定经度。
巴黎进行第一次定期气象观测。

生物学

1699年

法国班特列尔倡导将机械论哲学从物理世界扩大到人的世界的趋向。
德意志埃尔兰根建立骑士学院，主要为王子及贵族子弟提供政治教育，后发展为近代大学。
法国悲剧作家拉辛逝世，其代表作有《戴巴依特》、《亚历山大大帝》、《昂朵马格》、《费德尔》等。

政法

1699年

1月26日，奥地利、波兰、威尼斯等国的神圣同盟与土耳其订立《卡洛维茨和约》，规定原土耳其统治下的匈牙利特兰西瓦尼亚、克罗地亚和斯洛文尼亚，为奥地利所兼并。奥古斯都二世使波兰获得波多利亚和第聂伯河西岸的卡梅尼克和乌克兰；威尼斯获得摩里亚和爱琴海中土耳其所属各岛以及达尔马提亚的一些要塞。神圣同盟的另一成员俄国则继续对土进行战争。
11月，俄国同波兰、丹麦结成反对瑞典的“北方同盟”，签订了瓜分瑞典帝国的条约。

经济

1699年

1月至12月，康熙帝多次巡查黄河、淮河、运河沿岸，就疏浚运河、治理淮河水患、黄河堤坝加高加固等问题提出方案。
17世纪末，牛存喜发明了自山的两面同时开凿隧道通渠的测量和施工方法。
出现太仓式轧棉机，其效率为1人可抵原先4人。

1699年

4月，康熙第3次南巡时，检阅了杭州驻军。

1699年

丢利埃[瑞士]断言牛顿比莱布尼茨更早发明微积分，后者可能是剽窃，引起争端。

物理学