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位于乌鲁木齐市龙泉街。于1951年在乌鲁木齐（迪化）成立，时称中华医学会迪化分会，1954年改称中华医学会乌鲁木齐分会，1978年改称中华医学会新疆分会，1984年改称现名（在外事活动中仍称中华医学会新疆分会）。学会已产生了八届理事会。主办季刊《新疆医学》杂志。
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