水警稽查队指挥部

水警稽查队内由队长和副队长组成的部门。水警稽查队队长作为澳门水警稽查队的负责人，有权：(1)领导、统筹及监督水警稽查队的活动；(2)遵守并促使遵守法律、规章及上级指令；(3)就须上级决定的事宜作出报告，上呈待批；(4)行使获授予或者获转授予的权限； (5)为维持正常运作的需要，制定附属单位应遵守的规定；(6)将年度活动计划及有关预算送交上级审议；(7)担任法律规定应由该官职当然兼任的其他职务；(8)根据刑事诉讼法的规定发出逮捕令；(9)在进行刑事侦查时认别或者命令认别任何人的身份； (10)为维护公共秩序，依法命令在水警稽查队活动区域进行搜索及扣押。水警稽查队设副队长一名，负责：(1)辅助队长工作；(2)在队长不在、出缺或者依法不能视事时代任队长；(3)主持纪律委员会； (4)根据刑事诉讼法的规定发出逮捕令；(5)在刑事侦查过程中认别或者命令认别任何人的身份；(6)为维护公共秩序，依法命令在受水警稽查队监察的地点进行搜查及扣押。