特殊配合力specific combining ability,SCA

某一杂交组合F₁的实际值与根据双亲一般配合力估测的F₁预期值的偏差。在不考虑误差的前提下，计算公式为：

实际上必须采用双列杂交等设计的试验进行分析。试验设计方法不同，分析的公式也不同。由基因的显性效应、上位性效应及基因和环境的互作效应综合决定。选择一般配合力和特殊配合力都高的优异杂交组合，F₁代可以直接用于杂种优势。