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绿色植物通过光合作用将大气中的二氧化碳贮于碳水化合物内供一切生物代谢所需，生物代谢过程中或物质燃烧过程中分解碳水化合物，最终将二氧化碳释放至大气中的循环过程。其中以微生物分解土壤中的动植物残骸及动物排泄物的过程最为重要。仅有微生物存在时，碳素循环也能进行。
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