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位于同源染色体或非同源染色体上不同基因座间的基因。如果位于非同源染色体上，非等位基因的遗传服从自由组合规律(参见“自由组合规律”条)。如果位于同源染色体上，非等位基因的遗传服从完全连锁(参见“完全连锁”条)或连锁互换规律(参见“不完全连锁”、“互换”条)。
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